„Magazyny Historii” przedstawiają obiekty zachowane jako destrukty. Są to głównie samoloty z okresu pionierskiego i międzywojennego, pozostawione w stanie, w jakim przetrwały do czasów współczesnych. Na ich przykładzie można uzmysłowić sobie trudy renowacji obiektów kultury technicznej, jak również problemy związane z ewakuacją wielkogabarytowych zabytków w czasie działań wojennych.
W dawnym garażu 2 Pułku Lotniczego znajdują się kolejne trzy ekspozycje. Przez makietę wagonu towarowego prowadzi wejście na wystawę „Magazyny historii”, na którą składają się samoloty z okresu pionierskiego oraz międzywojennego. Samoloty te ocalały ze zniszczonego niemieckiego muzeum Deutsche Luftfahrtsammlung w Berlinie, zwanego kolekcją Göringa, które Niemcy ewakuowali podczas wojny z Berlina do Czarnkowa w Wielkopolsce i tam porzucili na stacji kolejowej.
Są one prezentowane w scenerii i stanie, w jakim je odnaleziono, bez przeprowadzenia żadnych prac remontowych. Wśród nich jest najstarszy samolot w zbiorach Muzeum – Levavasseur Antoinette z 1908 r. i inne samoloty z okresu pionierskiego, jak AEG Wagner Eule, Geest Möwe IV i wykonana w latach 30. replika Etricha Taube z 1910 r., pierwszego samolotu, jaki w 1912 r. pojawił się na rakowickim lotnisku.
Jednym z najciekawszych muzealiów jest prezentowany tutaj kadłub samolotu rekordowego Messerschmitt Me 209V1, który
w 1939 r. ustanowił rekord prędkości lotu wynoszący 755 km/h, dla samolotów tłokowych ważny przez 30 lat. Obok niego stoi kadłub samolotu szkolnego Albatros L.101 z 1930 r., używanego w Niemieckiej Szkole Pilotów Komunikacyjnych (Deutsche Verkehrsfliegerschule – DVS), będącej w istocie zakamuflowaną szkołą pilotów wojskowych, których istnienie w Republice Weimarskiej było zakazane na mocy Traktatu Wersalskiego. W lewym rogu sali stoi niemiecki wodnosamolot pływakowy Heinkel HE-5f z lat 20. XX wieku, a obok niego kratownica kadłuba amerykańskiego samolotu łącznikowego Stinson L-5 Sentinel, zdobytego przez Niemców podczas walk w Europie.
